最长公共子序列(LCS,Longest Common Subsequence)。其定义是,一个序列 S ,如果分别是两个或多个已知序列的子序列,且是所有符合此条件序列中最长的,则 S 称为已知序列的最长公共子序列。而最长公共子串(要求连续)和最长公共子序列是不同的。
设X(m)={x(1), x(2), x(3),….,x(m)} 和 Y(n)={y(1), y(2), y(3),….,y(n)}的最长公共子序列Z(k)={z(1), z(2),z(3),….,z(k)}
首先,将原问题分解为子问题,得出一个已知的结论: 当m或n等于0时,k等于0,即公共子序列长度为0
当m和n都不等于0时,此时分为三种情况:
(1) x(m) == y(n) ,此时z(k) = x(m) = y(n),该元素属于当前最长公共子序列的最后一个元素。此时Z(k-1)={ X(m-1)与Y(n-1)的最长公共子序列 }
(2) x(m) != y(n) ,且z(k) != x(m),此时Z={ X(m-1)与Y(n)的最长公共子序列 }
(3) x(m) != y(n) ,且z(k) != y(n),此时Z={ X(m)与Y(n-1)的最长公共子序列 }
其中X(m-1)={x(1), x(2), x(3),….,x(m-1)} , Y(n-1)={y(1), y(2), y(3),….,y(n-1)},Z(k-1)={z(1), z(2),z(3),….,z(k-1)}
上面三个步骤,每个步骤都是根据当前序列的状态, 将问题转化为已知解的子问题 (最初的已知解的子问题是当m==0或n==0时),从而求出当前问题的解。
由此便得出了该问题的状态转移方程,数学描述如下:
现有两个序列X={x 1 ,x 2 ,x 3, …x i },Y={y 1 ,y 2 ,y 3, ….,y i },
设一个C[i,j]: 保存X i 与Y j 的LCS的长度
最后,该算法的python实现:
# 最长公共子序列问题
__author__ = 'ice'
# arr_x,arr_y [0 ~ length-1]
# subarr_len [0,1~x_length][0,1~y_length]
# flag [0 ~ x_length-1][0 ~ y_length]
def lcs_length(arr_x, arr_y):
x_length = len(arr_x)
y_length = len(arr_y)
subarr_len = [[0 for j in range(y_length + 1)] for i in range(x_length + 1)]
flag = [[0 for j in range(y_length)] for i in range(x_length)]
for i in range(1, x_length + 1):
for j in range(1, y_length + 1):
if arr_x[i - 1] == arr_y[j - 1]:
subarr_len[i][j] = subarr_len[i - 1][j - 1] + 1
flag[i - 1][j - 1] = 1
elif subarr_len[i - 1][j] >= subarr_len[i][j - 1]:
subarr_len[i][j] = subarr_len[i - 1][j]
flag[i - 1][j - 1] = 2
else:
subarr_len[i][j] = subarr_len[i][j - 1]
flag[i - 1][j - 1] = 3
return {'subarr_length': subarr_len[x_length][y_length], 'flag': flag}
def lcs(arr_x, x_i, y_j, flag, result):
if x_i < 0 or y_j < 0:
return
if flag[x_i][y_j] == 1:
lcs(arr_x, x_i - 1, y_j - 1, flag, result)
result.append(arr_x[x_i])
elif flag[x_i][y_j] == 2:
lcs(arr_x, x_i - 1, y_j, flag, result)
elif flag[x_i][y_j] == 3:
lcs(arr_x, x_i, y_j - 1, flag, result)
array_x = ['a', 'b', 'c', 'b', 'd', 'a', 'b']
array_y = ['b', 'd', 'c', 'a', 'b', 'a']
longest_common_subsequence = []
lcs_info = lcs_length(array_x, array_y)
lcs(array_x, len(array_x) - 1, len(array_y) - 1, lcs_info['flag'], longest_common_subsequence)
print(longest_common_subsequence)